氫氣發生器和氮氣發生器，要注重所用試劑的純度以及管路是否漏氣，水蒸氣是首要的雜質。為了除去雜質的氣體中，要在氣源和儀器之間連接凈扮裝置。如分子篩或活性炭吸去除分子有機化合物，水蒸汽經由過程彩色膠除去。分子篩純化，活性炭和硅膠，在使用一段時間后，注意查抄和更換，更換后的填料可以從頭活化繼續使用，但要注重填充物的粉末堵塞氣體路徑。
如果儀器長期使用低純度的氣體氣源，一旦低濃度的需求過高，樣品以高純度要求，在要想恢復儀器的高靈敏度是十分困難的。如果選用高純度的氣體，這不僅會增添運營成本，還增添了的氣體路徑的復雜性，所以選用氣體的純度要求達到或略高于儀器自身對氣體純度的要求即可，這是為了達到工作要求，但也耽誤了儀器的使用壽命，進一步節省運營成本的東西。
為確保安全用氣，還需要考慮廢氣（放空氣體）的排放安全。如隔墊吹掃氣體，分流放空口和檢測器放空口等管路應盡量接到室外（利用氫氣為載氣時，它必需向屋外）。避免有毒和有害物質的室內空氣污染，危及操作者的健康， 同時也考慮氫氣作載氣時的安全問題。
由于嘗試室備用氣瓶，通風便利，所以氮氣利用的是鋼瓶；考慮到氫氣的利用安全，利用氫氣發生器；空氣源利用的是空氣壓縮機。為了去除氣態雜質，氮氣氣缸和氫生成裝有硅膠吸附裝置空氣發生器設置裝備擺設硅膠吸附器及一半活性炭和一半分子篩的吸附裝置。
儀器工作過程中的排空氣體（隔墊吹掃氣、分流出口，檢測器排氣口和載波 ），你要到戶外，視其對室內環境及平安的影響而定，和可燃氣體，平安方面的考慮，應在*。
因為從載氣隔墊吹掃氣體，當用氫氣作載氣時需將吹掃出口用管路連接到室外。室內安全和潔凈，分流放空口和檢測器放空口也應盡量用管路接到室外。
氣相色譜儀對各類氣體（載氣和輔助氣）的純度要求較高，一般要求氣體純度> 99 99％。氣體源供給的氣體的氣相色譜儀的高壓氣缸或氣體發生器中，在市場上的空氣壓縮機的今天，氫氣發生器和氮氣發生器，其它氣瓶都可以利用。
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